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有机废弃物如动物粪便、餐厨垃圾及污泥的好氧发酵处理一般工艺流程如下所示 ：
1）预处理 ：主要调整水分、营养比、破碎、分选、筛分等 ；
2）主发酵 ：又称一次发酵，是通过强制通风向发酵装置内堆肥物料供给氧气。物料内的有机物中大部分在此阶段内被降解；
3）后发酵 ：又称二次发酵，主要对主发酵时尚未分解的易分解和较难分解的有机物进一步分解，使之变成腐殖酸、氨基酸等比较稳定的有机物，得到完全成熟的堆肥制品。
4）后处理 ：主要筛分去除堆肥中的杂质和未完全分解堆肥块；
5）脱臭 ：堆肥过程中会产生臭气，需要对这些臭气进行处理；
6）贮存或利用 : 干燥透气环境储存或生产有机肥等情况。
好氧发酵生物堆肥反应器每小时旋转10次。电机的大小取决于容器的大小，范围为1.5到11KW。生物堆肥反应器的端部是固定的，只有滚筒旋转。碳钢壁厚度14毫米，重型安装支架，自动进料和出料。2个摩擦驱动器旋转生物堆肥反应器，加料量为容积的70%，容器可以是绝缘的，有助于保持所需的55-65度的较高工作温度，由于具有绝缘性，容器不需要安置在建筑物中，发酵过程是自然的，通常不需要增加热量。它是按照重型标准制造的，以承受每年365天，每天24小时的吨位和吨位物料搬运的严苛要求。这种新的堆肥处理系统与常见的堆肥方法完全不同。设计的好氧堆肥技术可严格控制固体有机废物的分解过程，并将有机材料可靠地转化为营养丰富的腐殖质。所产生的堆肥的质量要优于传统形式的堆肥。换句话说，它仅在4到7天内就已基本成熟。排放后，堆肥不含病原体，无昆虫幼虫，无杂草种子，几乎无味。将干净的空气吸入容器中，并将排出的空气收集到位于反应器排放端的管道中。空气被引导至生物过滤器进行过滤，然后释放到大气中。因为旋转的容器完成了所有工作，所以需要的人力更少，一个人可以操作整个过程。生物反应器有多种规格，日产量1-16吨，可多台并列组合使用，也可非标定做。从生物反应器中排出后，堆肥已成熟约80％。为了获得更大的成熟度，堆肥应再固化21天左右。自然存在于废料中的细菌会产生热量，这些热量是分解过程的副产品。生物反应器是绝缘的，因此热量不会散失到周围的空气中，所以就不需要外接热源。它广泛用于将有机废物加工成有机肥料，适用于各种有机废物，例如：动物粪便（猪粪，鸡粪，牛粪），农业废物，牲畜废物，厨房废物，市政污泥，工业废物，蘑菇残留物，农作物秸秆等。
